* პროფესიონალურ კლუბებში გამოსვლა და გოლები მხოლოდ ეროვნული ლიგებისთვის იანგარიშება ბოლოს განახლდა: 29 მაისი, 2017 ‡ ეროვნული ნაკრების მატჩი და გოლი ბოლოს განახლდა: 29 მაისი, 2017
თავისი პროფესიონალური კარიერა მან დაიწყო „ბრეშაში“ 1999 წელს, მას პირველივე სეზონში შეეძლო გადასულიყო სერია A-ში.
2000 წელს ის გახდა გუნდის სასტარტო შემადგენლობის ფეხბურთელი და გაატარა გუნდში ორი სეზონი და ითამაშა 60 მატჩი.
2002 წელს ბონერა გადავიდა „პარმაში“. ამ კლუბის შემადგენლობაში ბონერამ გაატარა 4 სეზონი, ითამაშა 139 მატჩი და გაიტანა 1 გოლი.
ის „მილანში“ 2006 წლიდან გამოდის. იტალიურ გაზეთებთან ინტერვიუებში დანიელე აცხადებდა რომ, „მილანში“ გადასვლა მისთვის სიურპრიზი იყო: „როდესაც მე გავიგე ამ ტრანსფერის შესახებ მე შოკში ვიყავი, გამოტყდა „პარმას“ ყოფილი მცველი. ასეთ შეგრძნებას შენ მაშინ ცდი, როდესაც ხედავ სუფთა ცაზე ელვას. როდესაც მე დამირეკა ჩემმა აგენტმა და მითხრა ამ ტრანსფერის შესახებ, თავიდან მეგონა რომ, ისე მე დამცინოდა. ეს ტრანსფერი ჩემი ოცნება იყო.“
იტალია
მილანი
